David Young, de la división americana de Nintendo, ha afirmado que The Legend of Zelda: Ocarina of Time 3D incluirá la versión Master Quest del título.
Esa versión se preparó para el 64DD, el accesorio de discos ópticos para Nintendo 64 que solo salió a la venta en Japón, pero el título no se comercializó jamás. Incluía nuevos puzles, localizaciones alternativas de objetos, enemigos más difíciles, etc.
No vio la luz hasta 2003, cuando se ofreció como disco especial junto a Wind Waker, en GameCube.
