Activision ha desvelado nuevos detalles e ilustraciones de los personajes de Protoype 2.
El coronel Rooks es un ferviente defensor de Blackwatch como linea de defensa frente a las amenazas biológicas contra Estados Unidos. Debida a esta lealtad, ha sido asignado a proteger la zona y mantener la cuarentena.
Por su parte, el doctor Koenig es jefe del grupo de virus en Gentek. Cuando se descubre que ha sido infectado por Mercer, la épica aventura de Koeing comenzará en el juego.