BioWare ha confirmado que Mass Effect 3 incluirá la opción de rejugar la historia principal con la función "New Game+" una vez terminado el juego, al igual que el primer título de la saga. Esta característica no se incluyó en Mass Effect 2, que sólo permitía completar misiones alternativas y el contenido descargable.
Casey Hudson, productor ejecutivo, ha confirmado que Mass Effect 3 utilizará una mezcla de ambos sistemas, permitiendo tanto rejugar la historia con los poderes potenciados como cerrar todas las misiones opcionales.
"Será probablemente una combinación de ambas ideas. Vamos a tener la oportunidad de volver y terminar el contenido, pero también podrás volver al inicio y hacerlo en una nueva partida."