No lo había querido hacer así porque para ser sinceros, no tengo ni puñetera idea y no sabia si se podía hacer, pero al leerte me he lanzado y no me lo puedo creer, estoy usando HEC-RAS en Ubuntu!

Mil gracias!

De nada   Si utilizas el sistema de perfiles (creo que wine los llama "prefijos") para cada aplicación importante que instales, no te preocupes por hacer trasstadas, que aunque te cargues ese perfil, los demás siguen funcionando correctamente xD

La verdad es que me fijé en eso de los prefijos pero no tengo ni puñetera idea de qué era, cuando tenga tiempo me pongo a trastear xD

Ándate a tomar por saco con el spam, tío.

Usas X.org con configuración o en plan automático?

Primero usé el driver privativo de ati con el aticonfig y al ver que nada intenté modificar las X manualmente pero nada. Al final reinstalé y tuve bastantes problemas con los drivers, cosa que nunca me había pasado. Algo habrán cambiado los de ati que me han jodido vivo xd.

Justo tengo que hacer un trabajo para la uni esta semana en Linux así que me meteré luego a echarle un ojo, a ver si todo sigue bien o si ha vuelto a fallar. Luego te digo y gracias  

En ese caso puedes cargar el recovery-mode, vamos, el modo en consola. Desactivas el entorno de escritorio y así puedes entrar desde el modo normal a la consola, una vez ahí añade los repositorios testing y actualízalos.

He visto algunos post en otro foro quejándose de problemas con la última versión de los drivers privativos de Ati. Supongo que esta empresa sigue sacando drivers que dan más problemas que alegrías. Al menos espero que vayan mejor que cuando yo tuve mi última Ati, una radeon 9700. Era la caña, en windows, pero en linux...  me estuve como unos dos años para hacerle andar la aceleración 3D en Debian.
A ver si ya no te da más problemas, y si hay dudas con algo... se pregunta

Yo también tengo esa y encantada de la vida : )