Top 30 DS 30º- Dragon Quest IV Chapters of the Chosen 29º- Suikoden Tierkreis 28º- Kirby Superstar Ultra 27º- Profesor Layton y la Caja de Pandora 26º- Ace Attorney: Justice for All 25º- El Profesor Layton y el Futuro Perdido 24º- Final Fantasy Tactics Advance 2 23º- Golden Sun: Oscuro Amanecer 22º- Elite Beat Agents 21º- Hotel Dusk: Room 215 20º- Advance Wars Dark Conflict 19º- Wario Ware Touched! 18º- The World Ends With You 17º- The Legend of Zelda: Spirit Tracks 16º- Final Fantasy IV 15º- Profesor Layton y la Villa misteriosa 14º- Dragon Quest V: La prometida Celestial 13º- Tingle el pimpollo y el vergel de Rupilandia 12º- Pokémon Blanco/Negro 11º- Ghost Trick: Detective Fantasma 10º- Chrono Trigger 9º- Advance Wars: Dual Strike 8º- Kirby y el Pincel del Poder 7º- New Super Mario Bros 6º- Rhythm Paradise 5º- Castlevania Dawn of Sorrow 4º- Mario Kart DS 3º- Ace Attorney Phoenix Wright 2º- Phoenix Wright: Trials & Tribulations 1º- Mario & Luigi 3: Viaje al centro de Bowser

TOP 30 GBA 30º- SMA 4: Super Mario Bros 3 29º- Megaman Zero 28º- Wario Ware Twisted 27º- Rhythm Tengoku 26º- Gunstar Future Heroes 25º- F-Zero Climax 24º- The Legend of Zelda: A Link to the Past 23º- Kirby: Nightmare in Dreamland 22º- Advance Wars 2: Black hole Rising 21º- Castlevania: Aria of Sorrow 20º- Fire Emblem: The Sacred Stones 19º- Kurukuru Kururin 18º- SMA 2: Super Mario World. 17º- Kingdom Hearts Chain Of Memories 16º- SMA 3: Yoshi's Island 15º- Pokémon Rubí/Zafiro/Esmeralda 14º- Advance Wars 13º- Final Fantasy Tactics Advance 12º- Wario Land 4 11º- Mario Kart Super Circuit 10º- Fire Emblem: Blazing Sword 9º- Golden Sun 8º- Final Fantasy VI Advance 7º- Golden Sun: La Edad Perdida 6º- Wario Ware Inc. 5º- Metroid Zero Mission 4º- Metroid Fusion 3º- Mother 3 2º- The Legend of Zelda: The Minish Cap 1º- Mario & Luigi SuperStar Saga

AL TURRÓN

Volver a votar los de GBA y ahora los de DS, ¿no?

Allá vamos...

NDS:
-The World Ends With You
-Phoenix Wright: Trials & Tribulations
-Kirby Power Paintbrush
-Pokémon Blanco/Negro
-Mario & Luigi: Bowser's Inside Story
-Profesor Layton y la Caja de Pandora
-Inazuma Eleven
-Castlevania Dawn of Sorrow
-Hotel Dusk: Room 215
-Elite Beat Agents

Lo siento por Kirby SSU, Chrono Trigger y Pokémon HG/SS, pero no quiero votar remakes ni ports. Phoenix Wright es excepción puesto que la versión GBA solo está en japo.

GBA (again):
-Mother 3
-Kirby and the Amazing Mirror
-Mario & Luigi SuperStar Saga
-Wario Ware Inc.
-Golden Sun
-Metroid Zero Mission
-Pokémon Rubí/Zafiro
-Megaman Zero 3
-Zelda Minish Cap
-Kingdom Hearts Chain Of Memories

Vale, Zero Mission es un remake, pero tiene cambios lo suficientemente sustanciales como para que lo valore.

Nintendo DS
-Mario & Luigi 3: Viaje al centro de Bowser
-Tingle el pimpollo y el vergel de Rupilandia
-Mario Kart DS
-Kirby y el Pincel del Poder
-Wario Ware Touched!
-El Profesor Layton y el Futuro Perdido
-Kirby Superstar Ultra
-Rhythm Paradise

Dejo un par de huecos para cuando juegue Advance Wars: Dark Conflict y los Phoenix Wright. No me sentiría cómodo excluyéndoles desde el principio habiendo oído cosas tan grandes de ellos.

Game Boy Advance
-Mother 3
-Mario & Luigi: Superstar Saga
-Wario Ware Inc: Minigame Manía
-The Legend of Zelda: The Minish Cap
-Fire Emblem: Blazing Sword
-Advance Wars
-Metroid Fusion
-Mario Kart Super Circuit
-Kirby: Nightmare in Dreamland

De DS me va a ser difícil sacar sólo 10 juegos. Voy a intentar no repetir saga, porque si no, entre Layton y Phoenix Wright, me comía 7 puestos xD:

Nintendo DS:

- Phoenix Wright: Trials and tribulations
- Profesor Layton y la Villa misteriosa
- Chrono Trigger
- Mario Kart DS
- Zelda Spirit Tracks
- Castlevania Dawn Of sorrow.
- Big Brain Academy
- New Super Mario Bros
- Pokemon Negro/Blanco
- Phoenix Wright
- Advance Wars: Dual Strike

De GBA he jugado bastante menos:

- Metroid Zero Mission
- Metroid Fusion
- Final Fantasy Tactics
- Zelda: Minish Cap
- Mother 3

Nintendo DS

- Advance Wars Dual Strike
- Advance Wars Dark Conflict
- Ace Attorney Phoenix Wright
- Ace Attorney Trials and Tribulations
- Rhythm Paradise
- Elite Beat Agents
- Hotel Dusk Room 215
- Mario & Luigi  3
- Kirby y el Pincel del Poder
- Mario Kart DS

GBA

- Metroid Fusion
- Wario Ware Minigame Mania
- SMA 3 Yoshi's Island
- Advance Wars
- Metroid Zero Mission
- Mario & Luigi Super Star Saga
- The Legend of Zelda: The Minish Cap
- Mother 3
- Mario Kart Super Circuit
- F-Zero Climax

DS:

- Mario Kart DS
- Final Fantasy Crystal Chronicles: Ring of Fates
- Advance Wars Dual Strike
- Mario & Luigi 3: Viaje al Centro de Bowser
- Meteos
- El Profesor Layton y la Villa Misteriosa
- Castlevania Dawn of Sorrow (me gustó más el Aria, pero no pude meterlo en GBA, así compenso XD)
- Mario Slam Basket
- Final Fantasy Tactics Advance 2 (como con el Castlevania, para compensar)
- Tingle el pimpollo y el vergel de Rupilandia

GBA:

- Mother 3
- Advance Wars
- Fire Emblem Blazing Sword
- Metroid Fusion
- Wario Ware Microgames Inc.
- Wario Land 4
- Mario Kart Super Circuit
- Pokémon Rubí/Zafiro/Esmeralda
- Golden Sun: La Edad Perdida
- Mario & Luigi Superstar Saga

No voto ni remakes ni ports por razones personales

Espero no olvidarme de ningún juego y tener que editar

EDIT: ¡Meteos! ¡Sabía que se me olvidaría alguno!  

Duda rápida antes de hacer el top: ¿por qué en DS no vale juegos japo y sí en GBA? Simple curiosidad. Más que nada porque eso me "obligaría" a meter al EBA en la lista de DS pudiendo poner Ouendan.

Nintendo DS:

-Might and Magic Clash of Heroes
-Picross DS
-Picross 3D
-Mario y Luigi 3 Viaje al centro de Bowser
-Final Fantasy Tactics Advance 2
-Castlevania Dawn of Sorrow
-Phoenix Wright: Ace Attorney
-Phoenix Wright: Trials and Tribulations
-Ghost Trick
-Etrian Odisey 2

Me dejo miles afuera, pero es que la DS tiene un catálogo tan numeroso que es imposible no dejarse joyas por el camino.
De GBA no pongo de momento que no tengo ganas de pensar tanto.

Obviando ports y remakes... Y sin órden concreto.

NDS

-Ghost Trick
-Tingle el pimpollo y el vergel de Rupilandia
-Advance Wars Dual Strike
-Kirby y el Pincel del Poder
-Mario & Luigi: Bowser's Inside Story
-Profesor Layton y la villa misteriosa
-Castlevania Dawn of Sorrow
-Contact
-Solatorobo: Red the hunter
-Flower, sun and rain...

GBA

-Mother 3
-The Legend of Zelda: The Minish Cap
-Mario & Luigi SuperStar Saga
-Kurukuru Kururin
-Advance Wars
-Metroid Fusion
-Final Fantasy Tactics Advance
-Fire Emblem Blazing Sword
-Wario Land 4
-Golden Sun II: La edad perdida

Votemos pues :

Nintendo DS:
-New Super Mario Bros
-Mario Kart DS
-Metroid Prime Hunters
-Castlevania: Order of Ecclesia
-Zelda: Phantom Hourglass
-GTA: Chinatown Wars
-Ninja Gaiden: Dragon Sword
-Final Fantasy Tactics A2
-Wario Ware Touched
-Nintendogs

Game Boy Advance:
-Golden Sun
-Mother 3
-Castlevania: Harmony of Dissonance
-Metroid Zero Mission
-FInal Fantasy Tactics Advance
-Zelda: the Minish Cup
-Final Fantasy VI Advance
-Wario Land 4
-Mario Kart Super Circuit
-Kingdom Hearts: Chain of Memories

GBA:

MOTHER 3
Metroid Fusion
Metroid Zero Mission
F-ZERO Climax
Mario & Luigi Superstar Saga
Wario Ware
Wario Ware Twisted
Megaman Zero
Final Fantasy VI
Super Robot Taisen Original Generation

Nintendo DS:

Mario & Luigi Viaje al Centro de Bowser
Infinite Space
Rhythm Paradise
Hotel Dusk
Jump Ultimate Stars
Advance Wars Dark Conflict
Ace Attorney
Ace Attorney 3
Dragon Quest V
Chrono Trigger

GBA:

- Advance Wars
- Advance Wars 2
- Fire Emblem
- Fire Emblem: The Sacred Stones
- Ninja Cop
- Castlevania: Aria of Sorrow
- Gunstar Future Heroes
- Tactic Ogre: The Knight of Lodis
- Mario & Luigi SuperStar Saga
- Astroboy Omega Factor

Nintendo DS:

- Contra 4
- 999
- Advance Wars Dual Strike
- Phoenix Wright Ace Attorney
- Phoenix Wright Trials & Tribulations
- Dragon Quest IV Chapters of the Chosen
- Castlevania Dawn of Sorrow
- Castlevania Order of Ecclesia
- Another Code: Two Memories
- Henry Hatsworth